太守は自らで設定はできません。
拠点にいる武将の能力等によって決まります。
裏切りやすい武将に関しては、もし太守になってしまっているようでしたら、君主のいる城に移動させるなどの対応をしましょう。
太守の確認は、画面右上の「情報」→「自勢力:武将」→「身分」をクリックで並べ替えをすると、太守が一覧で確認できます。
太守の能力ごと役割は次のようになります。
政治:拠点の耐久回復
武力:拠点の防衛、反撃、捕虜の拘束
知力:拠点の防衛、反撃、捕虜の拘束
上記のことから、武力か知力重視で人が配置されていることを確認しましょう。
統率の影響がないことがポイントです。